מכונת המילוי משמשת למילוי נוזלים או נוזלים סמיכים לבקבוקים, כמו: שמן בישול, שמן סיכה, שמפו, ריבה, דבש, משחת בשר, רוטב, כימיקלים חקלאיים, קוסמטיקה וכו'. על פי מוצרים שונים, היא יכולה לבחור בשיטות מילוי שונות : משאבת בוכנה, שקילה, משאבת רוטור, מד זרימה, כוח משיכה וכו'.